Después del prólogo lleno de acción, «Mary and the Witch’s Flower» entra en un mundo completamente nuevo. En la bucólica Inglaterra, otra niña pelirroja, Mary (Ruby Barnhill, en la versión doblada al inglés), espera los últimos días de las vacaciones de verano mientras se queda con su tía abuela Charlotte (Lynda Baron). El único otro niño alrededor es un niño llamado Peter (Louis Ashbourne Serkis), a quien Mary no le gusta sin razón aparente. Un día, sigue a un gato negro, que parece llamarla, como el conejo blanco de Alicia en el país de las maravillas, al bosque. En lo profundo del bosque, descubre un árbol retorcido con una escoba incorporada en su tronco y flores azules que brillan en sus raíces. Mary recoge una de las flores e inmediatamente es arrastrada hacia el cielo por la escoba, que la transporta a ella, y al gato, a una ciudad misteriosa y colorida que flota entre las nubes. Este es Endor College, una escuela para brujas.
La directora Madame Mumblechook (Kate Winslet) le da a Agog Mary un recorrido por la escuela y se convence de que Mary es un prodigio como nunca antes había visto. «Las brujas pelirrojas siempre han sido supremamente superiores», dice efusivamente. Mumblechook lleva a Mary a ver al doctor Dee (Jim Broadbent), un pequeño parecido a Lenin, que garabatea fórmulas en pizarras gigantes, tratando de perfeccionar sus silenciosas experiencias de transformación. Él también está impresionado por la promesa de María. Todo esto ocurre en un ambiente puro y casi majestuoso de acuerdo e intercambio de bromas. Sólo a la mitad de la película surge un conflicto. ¿Endor demasiado bueno para ser verdad? ¿Pues, qué piensas?
«Mary and the Witch’s Flower» se adentra de puntillas en un territorio bastante interesante sobre la magia, sus usos adecuados e inapropiados, incluso los inmorales y poco éticos. Finalmente, cuando Mary se enfrenta a Mumblechook y Dee, no dependerá de la magia para pasar, sino del ingenio y el coraje. Este no es el camino esperado para una película sobre magia; básicamente dice: “No lo necesitas. Ya tienes todo lo que necesitas contigo. “Encontré este aspecto de la película extremadamente emocionante, especialmente la forma en que se desarrolla en el último tercio.
